Anaconda的安装与配置
Anaconda的安装,网上都有教程:首先安装软件,然后添加环境变量
Anaconda保姆级安装配置教程(新手必看)_anaconda安装_江江ahh的博客-CSDN博客
设置环境变量的路径:
D:\ProgramData\Anaconda
D:\ProgramData\Anaconda\Scripts
D:\ProgramData\Anaconda\Library\bin
D:\ProgramData\Anaconda\Library\mingw-w64\bin
D:\ProgramData\Anaconda\Library\usr\bin
重点是如何知道已经正常安装,以及后期如何使用。
1.进入anaconda环境:
方法一:找到anacondaprompt,点击进入,注意进入后有一个(base)的标识。
方法二:找到命令提示符,输入activate,同样会进入anaconda环境,注意前面会多出(base)
Anaconda是可以创建虚拟环境的,刚才提到的base,就是基础的环境,你可以自己创建一个新的环境。比如:
condacreate-n10xpython=3.6
这里的10X就是环境的名字,你可以用condaactivate10x,去进入这个环境,后续的程序都是在这个环境中去运行的。
但这个对于刚开始接触的来说,可以不用那么复杂,先在base里面跑跑看,我觉得也没啥问题。
1、conda初始化
condainit
2、conda创建虚拟环境
condacreate-nyour_env_namepython=3.7
python=3.7是指定3.7以下适配可以安装的最新的python==3.7就是指定安装3.7这个版本
3、conda列出所有虚拟环境
condaenvlist
4、conda删除虚拟环境
condaremove-n需要删除的环境名--all
5、conda激活虚拟环境
condaactivateyour_env_name
2.安装包
通常使用pip安装包,pip的一些指令如下:
输入pip--version查看版本号
1.pip安装所需要的安装包
pipinstall所需安装包名字
2.pip查看已安装的包
pipshow--files安装包名字
3.pip检查哪些包需要更新
piplist--outdate
4.pip升级包
pipinstall--upgrade安装包名字
5.pip卸载安装包
pipuninstall安装包名字
有时安装包时会下载失败,这时候可能需要切换镜像
国内常用镜像:
pipconfigsetglobal.index-urlhttps://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple#清华
pipconfigsetglobal.index-urlhttp://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/#阿里云
pipconfigsetglobal.index-urlhttps://pypi.mirrors.ustc.edu.cn/simple/#中国科技大学
pipconfigsetglobal.index-urlhttp://pypi.hustunique.com/#华中理工大学
pipconfigsetglobal.index-urlhttp://pypi.sdutlinux.org/#山东理工大学
pipconfigsetglobal.index-urlhttp://pypi.douban.com/simple/#豆瓣
查看当前的镜像
pip3configlist
更改镜像:
使用如下命令更改到你希望的镜像,这里使用清华为例子。
pipconfigsetglobal.index-urlhttps://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple
安装包的时候遇到了:
ErrorMicrosoftVisualC++14.0isrequired
试了很多方法,都没有效果,还是老实下载visualstudio,勾选的内容如下,然后再次安装,就没有报错了。
anaconda常用命令:
到目前为止,相关的包已经装好了,后面就是如何使用了。
可以用pycharm,这个就相当于R中的Rstudio。
但是生信方面很多在用jupyter,所以这次也是用jupyter。